巴音郭楞职业技术学院的“3+2”专业包括电气自动化技术和现代纺织技术两个专业，这些专业面向理工类学生招生。目前，这些专业仅在新疆招生。报考该学院高职专业的学生，有机会参加新疆疆内的专升本考试，以及该学院与河北师范大学联合举办的专接本项目。