回文结构

一段自我互补的核苷酸序列，即同其互补链一样的序列，两者的阅读方向都是5′到3′。完全的回文结构，通常是各种Ⅱ型限制酶的识别位点。这些识别序列的核苷酸都作双重旋转对称排列，如果都从5′末端向3′末端读其碱基顺序，则在识别序列的两条核苷酸链中的碱基排列次序是完全相同的，这种结构形式称为回文结构，即正读与反读都相同。如限制酶BamHI的识别序列是： 5′-GGATCC-3′ 3′-CCTAGG-5′ 正读时是GGATCC，反读时也是GGATCC较不完全的回文结构经常出现其他蛋白质如阻遏物的结合位点。间断的回文结构使单链的核苷酸有可能形成发夹式的结构。