根据您的情况，作为甘肃省物理类学生且外语为日语，您可以报考重庆移通学院的工科类专业。关于外语考试，重庆移通学院允许用日语代替英语进行报考。但需要注意的是，该学院可能没有提供日语课程，这意味着您的日语学习可能需要通过其他途径进行。建议您直接联系重庆移通学院的招生办公室，以获取最准确的信息和指导。