在伊犁师范大学，学生公共外语课设置了大学日语课程，这意味着你可以继续学习日语。至于是否可以用日语成绩代替英语成绩毕业，这需要根据学校的毕业要求来确定。建议你直接咨询学校的教务处或相关部门以获取准确信息。