电气工程及其自动化专业在新疆工程学院的二本录取分数线近三年基本保持在超出省控制线90分以上。关于招生人数是否每年都在上涨的问题，目前提供的信息中没有明确说明，建议直接咨询学校招生办公室以获取最准确的招生人数变化情况。