中外合作专业是可以保研的，但保研率每年会根据教育部根据当年本科学生的招生数量下达的保研名额而变化。关于中外合作专业之间的转专业问题，一般情况下是不允许的，但云南大学云南马来亚学院今年新设立的3个专业允许在院内进行转专业。