生物医学工程专业毕业后，学生有多种就业选择。可以继续攻读硕士学位研究生，或者进入医院的影像、设备、临床工程、信息中心等相关科室工作。此外，还可以在医疗器械企业、事业单位、研究机构以及政府相关管理部门从事技术研发、技术支持、质量监督、技术审评等工作。首都医科大学等高校的该专业毕业生在就业市场上具有较强的竞争力。