哈尔滨工程大学“机械设计制造及其自动化（中外合作办学）”、“材料物理（中外合作办学）”、“土木工程（中外合作办学）”每年学费约在45000元左右；联合学院专业学费约在每年70000元，具体均以教育部实际批复为准。