中外合作办学植物保护专业是与内布拉斯加林肯大学合办的。毕业时，学生将获得西北农林科技大学和内布拉斯加林肯大学的两张学位证书。该专业采用3+1的培养模式，即前三年在国内的西北农林科技大学学习，最后一年需要出国到内布拉斯加林肯大学完成学业。